Begin 2000 werd door het stadsbestuur, met steun van de Provincie en Interreg begonnen met de uitbouw van een aanlegplaats voor riviertoerisme aan het oud sluis te Sint-Eloois-Vijve. Onder voorzitterschap van Marnix Dhanyns werd de vzw Waregem Yacht Club opgericht.
Dit voor de uitbouw van een jachthaven. In juli 2001 ging de jachtclub officieel van start en telde een 15-tal ligplaatsen. Al vlug bleek er grote interesse voor de yachthaven en werd uitbreiding noodzakelijk.
Met steun van het Interreg III-project, het stadsbestuur en de jachtclub zelf, werd de haven verder uitgebreid tot een aantal ligplaatsen van ongeveer 50. Dit met de nodige voorzieningen voor water en elektriciteit
Waregem Yacht Club is gelegen in een zijarm van de Leie aan de oude sluis te Sint-Eloois-Vijve. De ligging net buiten de vaargeul maakt dit tot een ideale locatie.